全球44家頂尖藥企
AI輔助藥研行動(dòng)白皮書
計(jì)算機(jī)/人工智能輔助新藥研發(fā)不是什么新鮮事物,早在1981年10月5日,美國《財(cái)富》雜志就對(duì)計(jì)算機(jī)輔助的藥物發(fā)現(xiàn)進(jìn)行了專題報(bào)道....
計(jì)算機(jī)/人工智能輔助新藥研發(fā)不是什么新鮮事物,早在1981年10月5日,美國《財(cái)富》雜志就對(duì)計(jì)算機(jī)輔助的藥物發(fā)現(xiàn)進(jìn)行了專題報(bào)道....
問:實(shí)驗(yàn)室的硬件條件好壞對(duì)你的科研有多大影響?
答:啥條件都行,沒有影響。
我們堅(jiān)信以下三點(diǎn)....
如何做到:速度要快,姿勢還要帥?
第一:堆新藥研發(fā)人才;
第二:外包,買現(xiàn)成管線;
第三:堆CADD/AIDD人才;
第四:堆資源,或者找個(gè)新藥研....
國內(nèi)企業(yè)在找CADD/AIDD人才方面現(xiàn)在是什么情況?我們?cè)趪鴥?nèi)9個(gè)主流招聘平臺(tái),相隔半年先后調(diào)查了兩次,一共覆蓋134家公司....
計(jì)算機(jī)/人工智能輔助新藥研發(fā)不是什么新鮮事物,早在1981年10月5日,美國《財(cái)富》雜志就對(duì)計(jì)算機(jī)輔助的藥物發(fā)現(xiàn)進(jìn)行了專題報(bào)道....
問:實(shí)驗(yàn)室的硬件條件好壞對(duì)你的科研有多大影響?
答:啥條件都行,沒有影響。
我們堅(jiān)信以下三點(diǎn)....
如何做到:速度要快,姿勢還要帥?
第一:堆新藥研發(fā)人才;
第二:外包,買現(xiàn)成管線;
第三:堆CADD/AIDD人才;
第四:堆資源,或者找個(gè)新藥研....
國內(nèi)企業(yè)在找CADD/AIDD人才方面現(xiàn)在是什么情況?我們?cè)趪鴥?nèi)9個(gè)主流招聘平臺(tái),相隔半年先后調(diào)查了兩次,一共覆蓋134家公司....
虛擬篩選
藥效預(yù)測
藥物分子
設(shè)計(jì)
藥物結(jié)構(gòu)
優(yōu)化
應(yīng)用與流程眾多,公司知識(shí)難以沉淀,復(fù)用率有待提高
手動(dòng)定制化Workflow,業(yè)務(wù)流程調(diào)整不方便, 應(yīng)用調(diào)優(yōu)困難,執(zhí)行效率低
無法可視化拖拽組件,無法查看中間數(shù)據(jù)
不同應(yīng)用與底層資源適配不靈活
海量基礎(chǔ)數(shù)據(jù)維護(hù)難(如開源分子庫數(shù)據(jù)整理)
眾多的內(nèi)外部數(shù)據(jù)分散、不統(tǒng)一,急需有效管理和治理
核心數(shù)據(jù)缺乏多重安全機(jī)制保障,安全性堪憂
數(shù)據(jù)無法形成資產(chǎn),復(fù)用率低
系統(tǒng)層面缺乏統(tǒng)一的管控和必要的審計(jì)
CADD/AIDD需要大量算力加快篩選過程和提高模型精度
研發(fā)項(xiàng)目眾多時(shí),資源爭搶,任務(wù)排隊(duì),時(shí)間更長
應(yīng)用并行度不足,無法發(fā)揮現(xiàn)有資源能力
應(yīng)用需求的計(jì)算多樣化,難以獲取所需的目標(biāo)資源
多地研發(fā)中心間協(xié)同復(fù)雜,維護(hù)成本高
統(tǒng)一身份認(rèn)證鑒權(quán),數(shù)據(jù)應(yīng)用代碼級(jí)別的安全協(xié)同困難
網(wǎng)絡(luò)傳輸穩(wěn)定性和性能風(fēng)險(xiǎn)對(duì)業(yè)務(wù)存在影響
在混合云需求下,IT運(yùn)維復(fù)雜,耗費(fèi)較多時(shí)間
自定義構(gòu)建可視化Workflow
簡化操作過程,提高研發(fā)效率
提供Zinc、Drugbank等開源/自由分子庫構(gòu)建與治理服務(wù)
提供海外站點(diǎn)研發(fā)數(shù)據(jù)庫高速下載
支持AlphaFold、RoseTTAFold等主流AI應(yīng)用
支持常見AI框架所需環(huán)境的快速搭建
支持更多研發(fā)組件按需集成
支持RESTful API業(yè)務(wù)對(duì)接現(xiàn)有客戶端
支持在平臺(tái)內(nèi)集成第三方生物/化學(xué)計(jì)算環(huán)境應(yīng)用
提供豐富計(jì)算資源,滿足不同場景的計(jì)算需求
大規(guī)模算力智能調(diào)度,提升研發(fā)效率,降低成本
專業(yè)BIO-IT專家團(tuán)隊(duì)輸出能力與經(jīng)驗(yàn)
支持自動(dòng)化運(yùn)維、監(jiān)控與告警
Gromacs、Rosetta、Vina
分子篩選、動(dòng)力學(xué)模擬、苗頭化合物優(yōu)化
1經(jīng)評(píng)估發(fā)現(xiàn)本地機(jī)房建設(shè)的投資較大且周期較長,同時(shí)缺乏IT團(tuán)隊(duì),影響業(yè)務(wù)開展,希望有平臺(tái)能快速幫助團(tuán)隊(duì)開展研發(fā)業(yè)務(wù)
2CADD團(tuán)隊(duì)最初只有一個(gè)人,希望能有專業(yè)服務(wù)商協(xié)助進(jìn)行軟件的測試和調(diào)試,同時(shí)提供對(duì)CADD業(yè)務(wù)場景的支持
3需要充足的CPU、GPU等算力資源,同時(shí)希望以低成本方式滿足高峰算力需求
4對(duì)數(shù)據(jù)安全有較高要求,要求計(jì)算環(huán)境私有化,確保數(shù)據(jù)資產(chǎn)安全
AlphaFold2
蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測
1本地計(jì)算資源有限,多部門爭搶,導(dǎo)致許多任務(wù)被推遲,效率不高
2AlphaFold2需要使用GPU來加速蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測,在實(shí)際業(yè)務(wù)中最多一次需跑十幾個(gè)任務(wù),并發(fā)需求多,如果按峰值購買GPU卡,一次性投入較高
3研發(fā)只了解應(yīng)用,對(duì)AlphaFold2軟件的調(diào)優(yōu)不夠熟悉
Schr?dinger、Vina、Rosetta、Gromacs
小分子篩選
1本地資源有限,項(xiàng)目需求緊迫,需將數(shù)月才能完成的分子篩選任務(wù)壓縮至幾天內(nèi)
2研發(fā)人員對(duì)應(yīng)用了解有限,不懂調(diào)優(yōu)配置,需IT專家提供支持
3IT人員沒有能力支持研發(fā)所需應(yīng)用的環(huán)境搭建、部署等工作,需要研發(fā)人員自己摸索,人力成本浪費(fèi)較大
4項(xiàng)目預(yù)算有限,希望盡量控制成本完成任務(wù)
Schr?dinger、LeDock
小分子虛擬篩選
1用戶不具備海外多分子庫及大規(guī)模數(shù)據(jù)的下載能力,并且由于多庫數(shù)據(jù)格式、結(jié)構(gòu)等不同,難以整合與管理多庫相關(guān)數(shù)據(jù)
2用戶不熟悉應(yīng)用工具的集群化并行使用,部分工具不支持并行運(yùn)行,單機(jī)運(yùn)行任務(wù)效率低
3本地資源配置低、數(shù)量少,無法滿足研發(fā)業(yè)務(wù)對(duì)效率的要求
Gromacs、Rosetta、Vina
分子篩選、動(dòng)力學(xué)模擬、苗頭化合物優(yōu)化
1經(jīng)評(píng)估發(fā)現(xiàn)本地機(jī)房建設(shè)的投資較大且周期較長,同時(shí)缺乏IT團(tuán)隊(duì),影響業(yè)務(wù)開展,希望有平臺(tái)能快速幫助團(tuán)隊(duì)開展研發(fā)業(yè)務(wù)
2CADD團(tuán)隊(duì)最初只有一個(gè)人,希望能有專業(yè)服務(wù)商協(xié)助進(jìn)行軟件的測試和調(diào)試,同時(shí)提供對(duì)CADD業(yè)務(wù)場景的支持
3需要充足的CPU、GPU等算力資源,同時(shí)希望以低成本方式滿足高峰算力需求
4對(duì)數(shù)據(jù)安全有較高要求,要求計(jì)算環(huán)境私有化,確保數(shù)據(jù)資產(chǎn)安全
AlphaFold2
蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測
1本地計(jì)算資源有限,多部門爭搶,導(dǎo)致許多任務(wù)被推遲,效率不高
2AlphaFold2需要使用GPU來加速蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測,在實(shí)際業(yè)務(wù)中最多一次需跑十幾個(gè)任務(wù),并發(fā)需求多,如果按峰值購買GPU卡,一次性投入較高
3研發(fā)只了解應(yīng)用,對(duì)AlphaFold2軟件的調(diào)優(yōu)不夠熟悉
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